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TaqMan探針?lè)ㄊ轻槍?duì)DNA上的SNP位點(diǎn)設(shè)計(jì)PCR引物和TaqMan探針,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增檢測(cè)的方法,通常用于少量SNP位點(diǎn)的分析,核酸定量分析以及腫瘤細(xì)胞突變分析等。探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個(gè)熒光報(bào)告基團(tuán)(Reporter,如FAM、VIC、HEX等)和一個(gè)熒光淬滅基團(tuán)(Quencher,如TAMRA、BHQ1等)。當(dāng)熒光探針保持完整時(shí),5′-端報(bào)告基團(tuán)經(jīng)儀器光源激發(fā)的熒光正好被近距離的3′端熒光基團(tuán)淬滅,儀器檢測(cè)不到5′端報(bào)告基團(tuán)所激發(fā)的熒光信號(hào)。PC...
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細(xì)胞STR分型介紹細(xì)胞STR分型(celllineSTRgenotyping)也稱為短串聯(lián)重復(fù)序列(shorttandemrepeat,STR)分型、簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)分型或微衛(wèi)星標(biāo)記(Microsatellite)分型,是檢測(cè)廣泛分布在真核生物基因組中的簡(jiǎn)單重復(fù)序列。一般由2-6bp的核心序列串聯(lián)重復(fù)而成,構(gòu)成了STR基因座的遺傳多態(tài)性。對(duì)于一個(gè)特定的個(gè)體,染色體上某個(gè)特定位置的重復(fù)序列的重復(fù)次數(shù)是固定的,而對(duì)于不同的個(gè)體重復(fù)次數(shù)可能不同,這就構(gòu)成了人群中STR的多態(tài)性...
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SNaPshot基因分型技術(shù)是由美國(guó)ABI公司開(kāi)發(fā)的一種基于熒光標(biāo)記單堿基延伸鏈終止反應(yīng)原理的分型技術(shù),主要針對(duì)中小通量的SNP分型項(xiàng)目。簡(jiǎn)單說(shuō)來(lái),在一個(gè)含有測(cè)序酶、四種熒光標(biāo)記ddNTP、緊臨SNP位點(diǎn)5’-端的不同長(zhǎng)度延伸引物和模板DNA的反應(yīng)體系中,引物延伸一個(gè)堿基即終止,經(jīng)ABI3730XL測(cè)序儀檢測(cè)后,根據(jù)峰的位置確定該延伸產(chǎn)物對(duì)應(yīng)的SNP位點(diǎn),而根據(jù)峰的顏色可得知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型。同時(shí),通過(guò)多重PCR反應(yīng)體系,可以同時(shí)檢測(cè)多種SNP位點(diǎn),通常...
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質(zhì)譜法基因分型技術(shù)簡(jiǎn)介DNA質(zhì)譜陣列基因分析系統(tǒng)以其通量高、自動(dòng)化、靈活、結(jié)果準(zhǔn)確、實(shí)驗(yàn)成本低廉等諸多優(yōu)勢(shì)成為了大學(xué)、醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所、生物技術(shù)公司、制藥企業(yè)、疾控中心等機(jī)構(gòu)所推崇的研究工具。應(yīng)用領(lǐng)域涵蓋醫(yī)學(xué)及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)、基因組學(xué)、表觀遺傳學(xué)、農(nóng)業(yè)遺傳育種及轉(zhuǎn)基因技術(shù)等相關(guān)領(lǐng)域。檢測(cè)儀器信息SequenomMassArray時(shí)間飛行質(zhì)譜生物芯片系統(tǒng)是為基因組學(xué)研究提供兼顧靈敏度和特異服務(wù)的中高通量技術(shù)平臺(tái),廣泛地應(yīng)用于遺傳突變檢測(cè)、SNP分型以及DNA甲基化定量分析...
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KASP基因分型介紹KASP(KompetitiveAllele-SpecificPCR),即競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR,原理上與TaqMan檢測(cè)法類似,都是基于終端熒光信號(hào)的讀取判斷,每孔反應(yīng)都是采用雙色熒光檢測(cè)一個(gè)SNP位點(diǎn)的兩種基因型,不同的SNP對(duì)應(yīng)著不同的熒光信號(hào)。KASP技術(shù)與TaqMan法類似,它與TaqMan技術(shù)不同的是,它不需要每個(gè)SNP位點(diǎn)都合成特異的熒光引物,它基于*的ARMPCR原理,所有的位點(diǎn)檢測(cè)終都可以使用通用熒光引物進(jìn)行擴(kuò)增,這降低了KASP技術(shù)...
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